教育部才說高中歷史教科書「日據」和「日治」二者皆可採用，
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，行政院又要求中央部會公文都要用「日據」。教育部主秘王作臺表示，
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，「多一種思維，
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，對下一代是好事」；教科書審定須呈現多元觀點，
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，但身為政府機關，
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，公文就須使用同樣的用詞。
王作臺表示，
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，政府本來就要表達立場，官方公文即代表國家，而教育部做為國家機關一分子，就須立場一致，使用同樣的用詞；教育部會遵循行政院決定，公文採用「日據」。
外界質疑中央內部不同調，王作臺表示，教科書須呈現不同的歷史觀點與文化價值，而課綱精神就是一綱多本，只要在允許的範圍內都能充分表現，「多一種思維，對下一代是好事。」但教育部和行政院維護中華民國主權的精神，並未相互違背。
此外，繼「日治」、「日據」之爭後，又有學者王仲孚不滿剛修訂完的高中課綱現代史，把武昌「起義」修改為武昌「起事」，要求教育部「不准用」；他強調，政府的立場只能有一個，歷史教科書並非學術著作，而是政府審查通過才能發行的書籍，不能用「學術自由」的尺檢視，他認為，教育部只准用「日據」及武昌「起義」。
王作臺表示，不管是「日治」、「日據」，還是武昌「起義」、「起事」，基於一綱多本精神，審定制度會尊重教科書編者依歷史脈絡的詮釋，保障憲法表達意見的自由；教育部已請辦理教科書審查的國家教育研究院，按照「日治或日據用法，都符合歷史教科書課綱編撰原則」來審訂，給予最大的寬容。，