檢警查出高鐵炸彈客胡宗賢在放置炸彈之前，
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，先賣掉價值一千多萬元的股票，
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，在放炸彈當天上午，
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，全部用於放空新加坡摩台指期貨，
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，因此認為他企圖製造連續炸彈攻擊事件獲利；但當天兩枚炸彈都沒爆，
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，台股未受影響，
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，他因此慘賠八百多萬元。
摩根台股指數採台灣證券交易所的九十一檔股票為樣本進行資本加權，
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，指數漲跌會受台股指數起伏影響，但指數震盪幅度比台股指數小，有投資客會選擇摩台股指數期貨避險或套利。
胡宗賢犯下高鐵炸彈案後，檢警認為他長期參與上市櫃公司經營權之爭，懷疑他要藉炸彈案影響股市，但胡否認。
檢方後來清查胡的投資過程與資金流向，查出胡宗賢今年三月陸續賣掉總值一千多萬元的股票，錢都轉入期貨公司交易帳戶內；四月十二日犯案當天上午，就以筆記型電腦登入期貨公司網路交易平台下單，以每次一百口，分五次放空五百口摩根台股指數期貨，成交價為二八一點二點。
檢方指出，胡宗賢期待藉由高鐵爆炸造成台股加權指數下跌而從中獲利。
胡宗賢指使同夥朱亞東放完炸彈行李之後，隨即駕車逃往桃園機場，在途中因無法順利上網登入交易平台，因此打電話給營業員，設定摩台指只要升到二八二點，就將稍早下單的指數期貨五百口全部平倉；途中還到桃園的銀行申請轉帳帳戶，好方便將可能的獲利全轉往他在新加坡開的帳戶。
胡宗賢隨後搭機逃到大陸等待結果；但炸彈沒爆，他買的摩台指期貨五百口在十九日被強制平倉後，只剩下兩百四十五萬元。
胡坦承買期貨，但否認操縱期貨市場，辯稱一切都是「巧合」；但檢方分析資金流向，查出他幾乎用所有資產購買摩台指期貨，懷疑胡打算在放炸彈當天「賭一把」；且炸彈案發生前後，胡不斷上網關切期貨指數，因此研判他的犯案動機應該是為錢。，