行政院組織改造，
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，從國民黨執政，
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，換到民進黨執政，
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，再到國民黨重新執政，
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，前後拖延數十年，
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，總算邁開腳步，
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，但是組織改造過程，卻暴露出機關本位主義，缺乏通盤檢討的問題。勞委會、衛生署都因為業務的專業考量，主張將原先的聘僱人員，在改制過程中轉為編制內公務員，因為人事員額暴增，增加政府財政支出總計超過百億元，這與組織整併的政策目標剛好是背道而馳。
政府組織改造推動困難，多半因為部會的本位考量各行其是，私下運作各方，透過立委牽制行政院方面的決策，扭曲組織改造的政策目標。政府推動組織改造，是要精簡政府人力，降低非必要的人事支出，曾經是百萬大軍的國防部，都砍到剩下20多萬人，但部分機關在裁併過程中，不能思考改造的政策目標，只想保有現有的資源，就會出現越改造人越多，人事負擔越沉重。
行政院主其事者沒有能夠拿起政治責任，遏止機關本位主義，才會造成這種機關精簡整併後，編制人員卻更多的怪現象。行政院根本就不該對勞委會、衛生署大開方便之門，破壞國家的官制官規，不僅違反組織精簡的目標，更是破壞國家人事政策與法規。
政府有許多業務需要專業人士，無可厚非，但現況許多專業人士無法滿足公務人員的任用資格，也是事實，要解決這個問題，並不是簡單的把編制外人員納編，破壞文官體制的穩定。政府應該思考的是如何改變人事制度，創造一個管道，讓專業人士可以成為公務員，而不是用艱澀的考試，嚇跑專業人才，影響政府取才。 ※延伸閱讀》
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