文化部等政府機構傳出不願搬遷的事，
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，而衛生福利部也曾面臨中部辦公室部分員工不願北遷難題，
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，後來採取「就地安置、出缺北補」方式，
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，逐步整併來度過陣痛期。
衛福部多年前發生中部辦公室員工抗拒北上工作的陣痛期，
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，原來早在民國九十年成立的國健局，
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，整併了新莊的整合保健處、公共衛生研究所，
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，以及台中的家庭計畫研究所、婦幼衛生研究所四個單位，當年中部員工不願到台北工作，後來衛生署（衛福部前身）採就地安置策略，一旦有缺額，再以北部任職方式補齊。
衛福部發言人王哲超說，考量目前台北辦公空間有限，加上中部辦公室原是接收精簡台灣省政府單位，若強制中部員工北上，恐不適宜。由於新科技進步，無論視訊或電話會議、網路電子公文十分方便，衛福部未強制中部員工須在台北同棟大樓辦公。
由於過往處理經驗，衛福部組織改造的搬遷，內部就相對平靜，至今仍未聽到抗爭意見。
包括國民健康署、附屬社會福利及醫療機構管理會、保護服務司、心理及口腔健康司、社會及家庭署，目前在中部辦公室仍設有據點，因此將維持現狀，未來不會搬至新大樓。，