馬英九總統在元旦祝詞表示樂見不限議題、各種型態的國是會議。府方人士昨表示，
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，國是會議最好由民間團體主導，
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，而非政黨主導。
積極推動內閣制憲改的民進黨前立委林濁水也認為，
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，雖然民進黨實質上具有主導能力，
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，但修憲是創造國家未來的公共財，
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，由公民團體主導會比較正面，
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，比如廿一世紀憲改聯盟；憲改議題是在政界尚未關注之前，公民團體已長期辛勤耕耘此議題，有學識亦有觀點，既然公民團體在藍綠兩黨皆有信賴感，應由民間主導較為適宜。
府方人士表示，對於馬總統在元旦祝詞提及社會和解、朝野合作等面向，已經著手規劃安排，不論國民黨和民進黨都有談國是會議，馬總統對任何型態的國是會議，沒有預設立場，也都樂觀其成、願意協助。
馬總統是否出席民進黨的國是會議？府方人士表示，還言之過早，要等收到邀請函再說，「但與其由政黨來主導，不如由民間團體發起，會比較適當。」
「民進黨只是一次選舉大勝，就想主導國是會議，未免太過頭。」國民黨立委賴士葆表示，馬政府任期還有一年多，國是會議應由總統府來主導，代表執政者下放權力、聆聽各方意見，除了民進黨提出的面向，也應該將兩岸政策納入國是會議來討論，透過朝野對話凝聚共識。
國民黨立委丁守中質疑，民進黨想主導國是會議，極不尊重憲政體制、不尊重民意機構，立委有堅實的民意基礎，也已成立修憲委員會，「為什麼要由民進黨舉辦國是會議，有何正當性？」
國民黨立委吳育昇認為，國是會議由任何政黨主導，都可能失之主觀，最好由社會公正人士、民間團體主導。，